Az ecsegi plebános püspöki helynöki minőségében 1673-ban megtartott egyházlátogatási jegyzőkönyvei szerint az egyházmegye területén 1672–73-ban Berczelen, Herencsényben, Kállóban, Mátraszőllősön és Palotáson voltak lelkészek. A vármegyének az esztergomi egyházmegyéhez tartozó területén pedig ugyanabban az időtájban Alsóesztergályon, a hol 1673–74-ben Blaskovics Menyhért, Nagyzellőben (Felsőzellő), a hol 1677-ben Keleffy János és Patakon, a hol Osvald Máté licenciatus végezte a lelkészi teendőket, voltak katholikus egyházak. 1677-ben Bujákon ismét volt katholikus plebános, név szerint Sajószentpéteri Szalay János. (Nagy Iván gyűjteménye.) A mikor az alkotmány felfüggesztése után Kolonics Lipót akkori bécsi érsek sürgetésére Lipót király új vértörvényszéket rendelt Pozsonyba, Nógrád vármegyéből a Lest, Lónyabánya, Losoncztamási, Nagykürtös, Nagylám, Parlagos (Polichnó) Turopolya (ma Túrmező) helységekben működő evangelikus lelkészeket is a pozsonyi vértörvényszék elé idézték. A megidézettek közűl a nagykürtösi evangelikus lelkész gályarabsággal bűnhődött, s társai közűl többen, így a lesti lelkész, nem tértek vissza híveik közé. A mikor a protestáns papokat gályarabságba, vagy börtönbe hurczolták, a bujdosó kuruczok rátámadtak a katholikus papokra, és közülök többet megöltek, vagy megraboltak és bántalmaztak. A folytonos zaklatások következtében a katholikus papság nem érezvén magát többé biztonságban, menekülni volt kénytelen s így azután az 1678–1684 . közötti években a megye területén csak egyes erődített helyeken, mint Füleken, Gácson és Divényben működtek kath. lelkészek.
A viszálykodások a felekezetek között gyakoriak voltak. 1682-ben Nagyorosziban a kálvinisták nagypénteken meghúzták a harangokat. E miatt zendülés támadt, mire a kamara a helység lakósai közűl négy katholikus és hét kálvinista gazdát felrendelt Pozsonyba.
Szécsény, Hollókő, majd Nógrád várának visszafoglalása után (1683–1686.) a török hódoltság is véget érvén, a vármegye területén megkezdődött a helyreállítás munkája a katholikus egyházakban is.